Protein–RNA interactions for Protein: P28222

HTR1B, 5-hydroxytryptamine receptor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1BP28222 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HTR1BP28222 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR1BP28222 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR1BP28222 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR1BP28222 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR1BP28222 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR1BP28222 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR1BP28222 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR1BP28222 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR1BP28222 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR1BP28222 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR1BP28222 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR1BP28222 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR1BP28222 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR1BP28222 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR1BP28222 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR1BP28222 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR1BP28222 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR1BP28222 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR1BP28222 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR1BP28222 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR1BP28222 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR1BP28222 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR1BP28222 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR1BP28222 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR1BP28222 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR1BP28222 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR1BP28222 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR1BP28222 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR1BP28222 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR1BP28222 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR1BP28222 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR1BP28222 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms