Protein–RNA interactions for Protein: P26440

IVD, Isovaleryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IVDP26440 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IVDP26440 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IVDP26440 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IVDP26440 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IVDP26440 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IVDP26440 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
IVDP26440 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IVDP26440 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IVDP26440 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IVDP26440 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IVDP26440 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IVDP26440 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IVDP26440 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IVDP26440 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IVDP26440 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IVDP26440 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IVDP26440 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IVDP26440 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IVDP26440 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IVDP26440 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IVDP26440 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IVDP26440 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IVDP26440 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IVDP26440 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IVDP26440 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IVDP26440 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IVDP26440 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IVDP26440 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IVDP26440 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IVDP26440 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IVDP26440 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IVDP26440 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IVDP26440 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IVDP26440 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IVDP26440 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IVDP26440 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IVDP26440 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IVDP26440 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IVDP26440 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IVDP26440 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IVDP26440 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IVDP26440 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IVDP26440 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IVDP26440 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IVDP26440 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IVDP26440 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IVDP26440 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IVDP26440 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IVDP26440 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IVDP26440 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IVDP26440 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IVDP26440 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IVDP26440 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IVDP26440 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IVDP26440 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IVDP26440 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IVDP26440 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IVDP26440 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IVDP26440 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IVDP26440 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IVDP26440 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IVDP26440 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IVDP26440 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IVDP26440 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IVDP26440 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IVDP26440 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IVDP26440 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IVDP26440 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IVDP26440 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IVDP26440 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IVDP26440 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IVDP26440 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IVDP26440 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IVDP26440 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IVDP26440 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IVDP26440 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IVDP26440 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IVDP26440 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IVDP26440 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IVDP26440 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IVDP26440 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IVDP26440 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IVDP26440 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IVDP26440 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IVDP26440 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IVDP26440 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IVDP26440 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IVDP26440 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IVDP26440 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IVDP26440 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IVDP26440 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IVDP26440 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IVDP26440 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IVDP26440 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IVDP26440 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IVDP26440 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IVDP26440 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IVDP26440 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IVDP26440 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IVDP26440 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms