Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM3P25205 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM3P25205 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM3P25205 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM3P25205 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM3P25205 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM3P25205 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM3P25205 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM3P25205 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM3P25205 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM3P25205 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM3P25205 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM3P25205 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCM3P25205 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCM3P25205 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCM3P25205 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCM3P25205 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCM3P25205 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MCM3P25205 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCM3P25205 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCM3P25205 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCM3P25205 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCM3P25205 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCM3P25205 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCM3P25205 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCM3P25205 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCM3P25205 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCM3P25205 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MCM3P25205 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCM3P25205 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCM3P25205 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCM3P25205 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCM3P25205 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCM3P25205 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCM3P25205 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCM3P25205 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCM3P25205 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCM3P25205 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCM3P25205 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCM3P25205 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCM3P25205 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCM3P25205 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCM3P25205 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCM3P25205 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MCM3P25205 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCM3P25205 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCM3P25205 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MCM3P25205 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MCM3P25205 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MCM3P25205 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCM3P25205 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCM3P25205 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCM3P25205 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCM3P25205 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCM3P25205 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCM3P25205 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCM3P25205 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM3P25205 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM3P25205 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM3P25205 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM3P25205 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM3P25205 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM3P25205 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM3P25205 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM3P25205 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM3P25205 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM3P25205 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM3P25205 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCM3P25205 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCM3P25205 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCM3P25205 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCM3P25205 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCM3P25205 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCM3P25205 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCM3P25205 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCM3P25205 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCM3P25205 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCM3P25205 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCM3P25205 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCM3P25205 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCM3P25205 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM3P25205 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM3P25205 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM3P25205 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM3P25205 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM3P25205 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM3P25205 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM3P25205 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM3P25205 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM3P25205 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM3P25205 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM3P25205 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM3P25205 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCM3P25205 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCM3P25205 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCM3P25205 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCM3P25205 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCM3P25205 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCM3P25205 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCM3P25205 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms