Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTAFRP25105 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms