Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SP100P23497 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SP100P23497 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SP100P23497 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SP100P23497 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SP100P23497 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SP100P23497 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SP100P23497 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SP100P23497 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SP100P23497 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SP100P23497 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SP100P23497 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SP100P23497 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SP100P23497 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SP100P23497 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SP100P23497 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SP100P23497 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SP100P23497 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SP100P23497 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SP100P23497 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SP100P23497 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SP100P23497 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SP100P23497 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SP100P23497 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SP100P23497 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SP100P23497 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SP100P23497 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SP100P23497 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SP100P23497 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SP100P23497 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SP100P23497 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SP100P23497 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SP100P23497 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SP100P23497 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SP100P23497 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SP100P23497 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SP100P23497 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SP100P23497 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SP100P23497 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SP100P23497 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SP100P23497 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SP100P23497 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP100P23497 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP100P23497 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SP100P23497 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SP100P23497 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP100P23497 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP100P23497 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP100P23497 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP100P23497 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SP100P23497 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP100P23497 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SP100P23497 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP100P23497 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP100P23497 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP100P23497 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP100P23497 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP100P23497 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP100P23497 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP100P23497 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP100P23497 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP100P23497 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SP100P23497 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SP100P23497 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SP100P23497 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SP100P23497 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SP100P23497 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SP100P23497 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SP100P23497 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SP100P23497 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SP100P23497 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SP100P23497 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SP100P23497 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SP100P23497 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SP100P23497 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SP100P23497 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SP100P23497 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SP100P23497 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SP100P23497 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SP100P23497 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SP100P23497 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SP100P23497 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SP100P23497 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SP100P23497 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SP100P23497 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SP100P23497 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SP100P23497 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SP100P23497 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SP100P23497 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP100P23497 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP100P23497 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP100P23497 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP100P23497 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP100P23497 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP100P23497 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SP100P23497 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP100P23497 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SP100P23497 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SP100P23497 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SP100P23497 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms