Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPRDP23468 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms