Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
XPAP23025 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
XPAP23025 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
XPAP23025 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XPAP23025 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XPAP23025 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XPAP23025 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XPAP23025 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XPAP23025 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XPAP23025 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XPAP23025 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XPAP23025 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XPAP23025 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XPAP23025 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
XPAP23025 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
XPAP23025 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XPAP23025 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XPAP23025 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XPAP23025 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
XPAP23025 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
XPAP23025 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
XPAP23025 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPAP23025 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPAP23025 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPAP23025 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPAP23025 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPAP23025 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPAP23025 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPAP23025 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPAP23025 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPAP23025 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPAP23025 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPAP23025 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPAP23025 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPAP23025 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPAP23025 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XPAP23025 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XPAP23025 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XPAP23025 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XPAP23025 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XPAP23025 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XPAP23025 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XPAP23025 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XPAP23025 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XPAP23025 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
XPAP23025 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XPAP23025 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XPAP23025 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XPAP23025 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XPAP23025 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XPAP23025 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XPAP23025 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XPAP23025 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XPAP23025 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
XPAP23025 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XPAP23025 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
XPAP23025 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XPAP23025 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XPAP23025 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XPAP23025 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XPAP23025 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XPAP23025 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XPAP23025 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XPAP23025 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XPAP23025 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
XPAP23025 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XPAP23025 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
XPAP23025 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPAP23025 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPAP23025 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPAP23025 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPAP23025 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPAP23025 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPAP23025 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPAP23025 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPAP23025 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPAP23025 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPAP23025 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPAP23025 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPAP23025 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPAP23025 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XPAP23025 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XPAP23025 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XPAP23025 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XPAP23025 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XPAP23025 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XPAP23025 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XPAP23025 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XPAP23025 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XPAP23025 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XPAP23025 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XPAP23025 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XPAP23025 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
XPAP23025 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
XPAP23025 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
XPAP23025 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XPAP23025 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XPAP23025 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XPAP23025 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XPAP23025 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms