Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASTP20810 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CASTP20810 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CASTP20810 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASTP20810 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASTP20810 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASTP20810 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASTP20810 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASTP20810 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASTP20810 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASTP20810 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASTP20810 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CASTP20810 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CASTP20810 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CASTP20810 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CASTP20810 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CASTP20810 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CASTP20810 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CASTP20810 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CASTP20810 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CASTP20810 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CASTP20810 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASTP20810 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASTP20810 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CASTP20810 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASTP20810 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASTP20810 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASTP20810 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASTP20810 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASTP20810 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASTP20810 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASTP20810 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CASTP20810 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASTP20810 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASTP20810 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CASTP20810 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CASTP20810 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CASTP20810 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CASTP20810 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CASTP20810 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CASTP20810 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CASTP20810 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CASTP20810 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CASTP20810 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CASTP20810 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CASTP20810 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CASTP20810 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CASTP20810 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CASTP20810 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CASTP20810 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CASTP20810 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CASTP20810 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CASTP20810 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CASTP20810 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CASTP20810 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CASTP20810 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CASTP20810 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CASTP20810 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CASTP20810 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CASTP20810 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CASTP20810 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CASTP20810 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CASTP20810 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CASTP20810 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CASTP20810 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CASTP20810 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CASTP20810 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CASTP20810 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CASTP20810 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CASTP20810 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CASTP20810 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CASTP20810 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CASTP20810 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CASTP20810 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CASTP20810 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CASTP20810 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CASTP20810 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CASTP20810 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CASTP20810 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CASTP20810 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CASTP20810 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CASTP20810 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CASTP20810 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CASTP20810 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CASTP20810 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CASTP20810 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CASTP20810 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CASTP20810 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CASTP20810 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CASTP20810 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CASTP20810 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CASTP20810 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CASTP20810 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CASTP20810 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CASTP20810 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CASTP20810 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CASTP20810 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CASTP20810 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASTP20810 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASTP20810 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms