Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DPA1P20036 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms