Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARF4P18085 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARF4P18085 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARF4P18085 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARF4P18085 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARF4P18085 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARF4P18085 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARF4P18085 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARF4P18085 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARF4P18085 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARF4P18085 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARF4P18085 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARF4P18085 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARF4P18085 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARF4P18085 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARF4P18085 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARF4P18085 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARF4P18085 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARF4P18085 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARF4P18085 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARF4P18085 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ARF4P18085 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARF4P18085 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARF4P18085 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARF4P18085 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARF4P18085 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARF4P18085 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARF4P18085 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARF4P18085 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARF4P18085 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARF4P18085 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARF4P18085 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARF4P18085 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARF4P18085 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARF4P18085 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARF4P18085 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARF4P18085 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARF4P18085 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARF4P18085 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARF4P18085 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARF4P18085 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARF4P18085 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARF4P18085 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARF4P18085 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARF4P18085 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARF4P18085 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARF4P18085 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARF4P18085 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARF4P18085 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARF4P18085 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARF4P18085 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARF4P18085 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARF4P18085 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARF4P18085 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARF4P18085 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARF4P18085 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARF4P18085 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARF4P18085 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARF4P18085 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARF4P18085 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARF4P18085 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARF4P18085 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARF4P18085 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARF4P18085 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARF4P18085 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARF4P18085 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARF4P18085 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARF4P18085 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARF4P18085 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARF4P18085 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARF4P18085 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARF4P18085 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARF4P18085 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARF4P18085 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARF4P18085 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ARF4P18085 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARF4P18085 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARF4P18085 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ARF4P18085 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARF4P18085 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARF4P18085 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARF4P18085 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARF4P18085 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARF4P18085 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARF4P18085 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARF4P18085 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARF4P18085 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARF4P18085 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARF4P18085 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARF4P18085 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARF4P18085 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARF4P18085 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARF4P18085 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ARF4P18085 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARF4P18085 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARF4P18085 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARF4P18085 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARF4P18085 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARF4P18085 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARF4P18085 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms