Protein–RNA interactions for Protein: P18074

ERCC2, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC2P18074 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms