Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPN1P18031 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN1P18031 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms