Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD44P16070 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD44P16070 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD44P16070 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CD44P16070 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD44P16070 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD44P16070 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD44P16070 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD44P16070 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD44P16070 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD44P16070 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD44P16070 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CD44P16070 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD44P16070 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD44P16070 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD44P16070 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD44P16070 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD44P16070 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD44P16070 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD44P16070 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CD44P16070 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD44P16070 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD44P16070 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD44P16070 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD44P16070 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD44P16070 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD44P16070 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD44P16070 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD44P16070 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD44P16070 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD44P16070 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD44P16070 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD44P16070 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD44P16070 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD44P16070 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD44P16070 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD44P16070 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD44P16070 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD44P16070 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD44P16070 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD44P16070 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD44P16070 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD44P16070 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD44P16070 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD44P16070 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD44P16070 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD44P16070 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CD44P16070 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CD44P16070 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CD44P16070 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CD44P16070 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD44P16070 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD44P16070 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD44P16070 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD44P16070 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD44P16070 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD44P16070 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD44P16070 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD44P16070 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD44P16070 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD44P16070 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD44P16070 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD44P16070 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CD44P16070 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD44P16070 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD44P16070 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD44P16070 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD44P16070 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD44P16070 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD44P16070 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD44P16070 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD44P16070 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD44P16070 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CD44P16070 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD44P16070 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD44P16070 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD44P16070 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD44P16070 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD44P16070 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD44P16070 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD44P16070 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD44P16070 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD44P16070 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CD44P16070 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD44P16070 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD44P16070 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD44P16070 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD44P16070 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD44P16070 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CD44P16070 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD44P16070 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD44P16070 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD44P16070 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD44P16070 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CD44P16070 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD44P16070 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD44P16070 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD44P16070 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD44P16070 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD44P16070 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms