Protein–RNA interactions for Protein: P11362

FGFR1, Fibroblast growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR1P11362 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGFR1P11362 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGFR1P11362 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGFR1P11362 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGFR1P11362 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGFR1P11362 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGFR1P11362 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGFR1P11362 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGFR1P11362 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGFR1P11362 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGFR1P11362 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGFR1P11362 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGFR1P11362 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGFR1P11362 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGFR1P11362 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGFR1P11362 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGFR1P11362 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGFR1P11362 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGFR1P11362 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGFR1P11362 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms