Protein–RNA interactions for Protein: P11279

LAMP1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP1P11279 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LAMP1P11279 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LAMP1P11279 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LAMP1P11279 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LAMP1P11279 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LAMP1P11279 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LAMP1P11279 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms