Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MCF2P10911 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCF2P10911 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCF2P10911 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCF2P10911 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCF2P10911 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCF2P10911 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCF2P10911 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MCF2P10911 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCF2P10911 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MCF2P10911 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCF2P10911 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCF2P10911 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MCF2P10911 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCF2P10911 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MCF2P10911 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCF2P10911 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCF2P10911 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCF2P10911 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCF2P10911 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCF2P10911 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCF2P10911 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCF2P10911 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCF2P10911 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCF2P10911 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCF2P10911 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCF2P10911 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCF2P10911 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCF2P10911 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCF2P10911 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCF2P10911 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCF2P10911 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCF2P10911 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCF2P10911 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCF2P10911 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCF2P10911 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCF2P10911 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCF2P10911 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCF2P10911 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCF2P10911 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCF2P10911 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCF2P10911 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCF2P10911 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCF2P10911 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCF2P10911 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCF2P10911 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCF2P10911 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCF2P10911 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MCF2P10911 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MCF2P10911 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCF2P10911 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCF2P10911 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCF2P10911 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCF2P10911 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCF2P10911 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCF2P10911 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCF2P10911 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCF2P10911 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCF2P10911 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCF2P10911 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCF2P10911 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MCF2P10911 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MCF2P10911 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MCF2P10911 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCF2P10911 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCF2P10911 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCF2P10911 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCF2P10911 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCF2P10911 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCF2P10911 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCF2P10911 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCF2P10911 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCF2P10911 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCF2P10911 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCF2P10911 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCF2P10911 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCF2P10911 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCF2P10911 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCF2P10911 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCF2P10911 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCF2P10911 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCF2P10911 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCF2P10911 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MCF2P10911 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCF2P10911 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MCF2P10911 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MCF2P10911 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCF2P10911 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MCF2P10911 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MCF2P10911 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCF2P10911 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MCF2P10911 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCF2P10911 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCF2P10911 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCF2P10911 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCF2P10911 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCF2P10911 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCF2P10911 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCF2P10911 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCF2P10911 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms