Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
GLI2P10070 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
GLI2P10070 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
GLI2P10070 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
GLI2P10070 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
GLI2P10070 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
GLI2P10070 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
GLI2P10070 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
GLI2P10070 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
GLI2P10070 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
GLI2P10070 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
GLI2P10070 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
GLI2P10070 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
GLI2P10070 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
GLI2P10070 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
GLI2P10070 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
GLI2P10070 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
GLI2P10070 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC34.8■■■■□ 3.16
GLI2P10070 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
GLI2P10070 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
GLI2P10070 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
GLI2P10070 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
GLI2P10070 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
GLI2P10070 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
GLI2P10070 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
GLI2P10070 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
GLI2P10070 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
GLI2P10070 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
GLI2P10070 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
GLI2P10070 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
GLI2P10070 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
GLI2P10070 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
GLI2P10070 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
GLI2P10070 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
GLI2P10070 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
GLI2P10070 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
GLI2P10070 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
GLI2P10070 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
GLI2P10070 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
GLI2P10070 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
GLI2P10070 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
GLI2P10070 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
GLI2P10070 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
GLI2P10070 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC34.76■■■■□ 3.16
GLI2P10070 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
GLI2P10070 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
GLI2P10070 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
GLI2P10070 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
GLI2P10070 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
GLI2P10070 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
GLI2P10070 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
GLI2P10070 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
GLI2P10070 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
GLI2P10070 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
GLI2P10070 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
GLI2P10070 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
GLI2P10070 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
GLI2P10070 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
GLI2P10070 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
GLI2P10070 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
GLI2P10070 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
GLI2P10070 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
GLI2P10070 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
GLI2P10070 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
GLI2P10070 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
GLI2P10070 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
GLI2P10070 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
GLI2P10070 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
GLI2P10070 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
GLI2P10070 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
GLI2P10070 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
GLI2P10070 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
GLI2P10070 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
GLI2P10070 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
GLI2P10070 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
GLI2P10070 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
GLI2P10070 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
GLI2P10070 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
GLI2P10070 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
GLI2P10070 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
GLI2P10070 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC34.7■■■■□ 3.15
GLI2P10070 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
GLI2P10070 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
GLI2P10070 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
GLI2P10070 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
GLI2P10070 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC34.7■■■■□ 3.14
GLI2P10070 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
GLI2P10070 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
GLI2P10070 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
GLI2P10070 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
GLI2P10070 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
GLI2P10070 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
GLI2P10070 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
GLI2P10070 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
GLI2P10070 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
GLI2P10070 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
GLI2P10070 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
GLI2P10070 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
GLI2P10070 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
GLI2P10070 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms