Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC2BP0DI82 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAPPC2BP0DI82 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC2BP0DI82 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC2BP0DI82 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC2BP0DI82 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC2BP0DI82 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC2BP0DI82 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC2BP0DI82 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC2BP0DI82 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC2BP0DI82 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC2BP0DI82 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC2BP0DI82 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC2BP0DI82 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC2BP0DI82 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC2BP0DI82 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC2BP0DI82 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC2BP0DI82 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC2BP0DI82 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms