Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB5P09067 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms