Protein–RNA interactions for Protein: P08865

RPSA, 40S ribosomal protein SA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP08865 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPSAP08865 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPSAP08865 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPSAP08865 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPSAP08865 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPSAP08865 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPSAP08865 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPSAP08865 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPSAP08865 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPSAP08865 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPSAP08865 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPSAP08865 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPSAP08865 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPSAP08865 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPSAP08865 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPSAP08865 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPSAP08865 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPSAP08865 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPSAP08865 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPSAP08865 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPSAP08865 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPSAP08865 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPSAP08865 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPSAP08865 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPSAP08865 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPSAP08865 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPSAP08865 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPSAP08865 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPSAP08865 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPSAP08865 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPSAP08865 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPSAP08865 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPSAP08865 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPSAP08865 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPSAP08865 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPSAP08865 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPSAP08865 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPSAP08865 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPSAP08865 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPSAP08865 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RPSAP08865 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPSAP08865 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPSAP08865 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPSAP08865 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPSAP08865 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPSAP08865 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPSAP08865 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPSAP08865 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPSAP08865 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPSAP08865 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPSAP08865 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPSAP08865 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPSAP08865 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPSAP08865 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPSAP08865 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPSAP08865 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
RPSAP08865 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPSAP08865 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPSAP08865 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPSAP08865 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPSAP08865 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPSAP08865 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPSAP08865 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPSAP08865 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPSAP08865 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPSAP08865 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPSAP08865 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPSAP08865 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPSAP08865 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPSAP08865 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPSAP08865 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPSAP08865 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPSAP08865 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPSAP08865 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPSAP08865 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPSAP08865 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPSAP08865 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPSAP08865 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPSAP08865 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPSAP08865 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RPSAP08865 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPSAP08865 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPSAP08865 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPSAP08865 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPSAP08865 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RPSAP08865 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPSAP08865 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPSAP08865 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPSAP08865 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPSAP08865 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPSAP08865 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPSAP08865 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPSAP08865 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPSAP08865 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPSAP08865 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPSAP08865 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPSAP08865 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPSAP08865 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPSAP08865 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPSAP08865 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms