Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GLI1P08151 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GLI1P08151 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GLI1P08151 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GLI1P08151 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GLI1P08151 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GLI1P08151 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GLI1P08151 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GLI1P08151 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GLI1P08151 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GLI1P08151 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GLI1P08151 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GLI1P08151 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GLI1P08151 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GLI1P08151 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GLI1P08151 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GLI1P08151 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GLI1P08151 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GLI1P08151 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GLI1P08151 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GLI1P08151 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GLI1P08151 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GLI1P08151 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GLI1P08151 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GLI1P08151 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GLI1P08151 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GLI1P08151 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GLI1P08151 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GLI1P08151 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GLI1P08151 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GLI1P08151 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GLI1P08151 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GLI1P08151 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GLI1P08151 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GLI1P08151 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GLI1P08151 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GLI1P08151 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GLI1P08151 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GLI1P08151 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GLI1P08151 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GLI1P08151 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GLI1P08151 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GLI1P08151 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GLI1P08151 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GLI1P08151 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GLI1P08151 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GLI1P08151 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GLI1P08151 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GLI1P08151 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GLI1P08151 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GLI1P08151 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GLI1P08151 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GLI1P08151 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GLI1P08151 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GLI1P08151 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GLI1P08151 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GLI1P08151 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GLI1P08151 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GLI1P08151 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GLI1P08151 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GLI1P08151 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GLI1P08151 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GLI1P08151 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GLI1P08151 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLI1P08151 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLI1P08151 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLI1P08151 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GLI1P08151 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLI1P08151 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLI1P08151 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLI1P08151 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLI1P08151 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLI1P08151 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GLI1P08151 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLI1P08151 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLI1P08151 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLI1P08151 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLI1P08151 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLI1P08151 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLI1P08151 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLI1P08151 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLI1P08151 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLI1P08151 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLI1P08151 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLI1P08151 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GLI1P08151 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GLI1P08151 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GLI1P08151 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GLI1P08151 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GLI1P08151 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GLI1P08151 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GLI1P08151 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GLI1P08151 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GLI1P08151 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GLI1P08151 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GLI1P08151 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GLI1P08151 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GLI1P08151 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GLI1P08151 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLI1P08151 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms