Protein–RNA interactions for Protein: P07437

TUBB, Tubulin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBBP07437 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBBP07437 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBBP07437 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBBP07437 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBBP07437 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBBP07437 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBBP07437 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBBP07437 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBBP07437 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBBP07437 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBBP07437 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBBP07437 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBBP07437 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBBP07437 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBBP07437 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBBP07437 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBBP07437 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBBP07437 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBBP07437 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBBP07437 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBBP07437 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBBP07437 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBBP07437 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBBP07437 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBBP07437 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBBP07437 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBBP07437 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBBP07437 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBBP07437 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBBP07437 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBBP07437 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBBP07437 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBBP07437 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBBP07437 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBBP07437 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBBP07437 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBBP07437 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBBP07437 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBBP07437 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBBP07437 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBBP07437 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBBP07437 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBBP07437 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBBP07437 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBBP07437 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBBP07437 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBBP07437 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBBP07437 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBBP07437 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBBP07437 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBBP07437 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBBP07437 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBBP07437 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBBP07437 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBBP07437 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBBP07437 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBBP07437 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBBP07437 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBBP07437 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBBP07437 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBBP07437 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBBP07437 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBBP07437 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBBP07437 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBBP07437 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBBP07437 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBBP07437 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBBP07437 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBBP07437 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBBP07437 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBBP07437 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBBP07437 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBBP07437 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBBP07437 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBBP07437 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBBP07437 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBBP07437 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBBP07437 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBBP07437 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBBP07437 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBBP07437 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBBP07437 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBBP07437 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBBP07437 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBBP07437 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBBP07437 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBBP07437 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBBP07437 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBBP07437 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBBP07437 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBBP07437 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBBP07437 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBBP07437 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBBP07437 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBBP07437 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBBP07437 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBBP07437 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBBP07437 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBBP07437 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBBP07437 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms