Protein–RNA interactions for Protein: P06858

LPL, Lipoprotein lipase, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPLP06858 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LPLP06858 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LPLP06858 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LPLP06858 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LPLP06858 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LPLP06858 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LPLP06858 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LPLP06858 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LPLP06858 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LPLP06858 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LPLP06858 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LPLP06858 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LPLP06858 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LPLP06858 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LPLP06858 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LPLP06858 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LPLP06858 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LPLP06858 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LPLP06858 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LPLP06858 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LPLP06858 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LPLP06858 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LPLP06858 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LPLP06858 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LPLP06858 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LPLP06858 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LPLP06858 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LPLP06858 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LPLP06858 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LPLP06858 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LPLP06858 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LPLP06858 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LPLP06858 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LPLP06858 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LPLP06858 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LPLP06858 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LPLP06858 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LPLP06858 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LPLP06858 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LPLP06858 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LPLP06858 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LPLP06858 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LPLP06858 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LPLP06858 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LPLP06858 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LPLP06858 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LPLP06858 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LPLP06858 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LPLP06858 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LPLP06858 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LPLP06858 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LPLP06858 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LPLP06858 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LPLP06858 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LPLP06858 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LPLP06858 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LPLP06858 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LPLP06858 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LPLP06858 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LPLP06858 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LPLP06858 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LPLP06858 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LPLP06858 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LPLP06858 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LPLP06858 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LPLP06858 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LPLP06858 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LPLP06858 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LPLP06858 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LPLP06858 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LPLP06858 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LPLP06858 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LPLP06858 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LPLP06858 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LPLP06858 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LPLP06858 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LPLP06858 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LPLP06858 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LPLP06858 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LPLP06858 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LPLP06858 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LPLP06858 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LPLP06858 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LPLP06858 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LPLP06858 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LPLP06858 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LPLP06858 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LPLP06858 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LPLP06858 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LPLP06858 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LPLP06858 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LPLP06858 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LPLP06858 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LPLP06858 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LPLP06858 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LPLP06858 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LPLP06858 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LPLP06858 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LPLP06858 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LPLP06858 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms