Protein–RNA interactions for Protein: P06401

PGR, Progesterone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRP06401 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGRP06401 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGRP06401 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGRP06401 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGRP06401 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGRP06401 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGRP06401 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGRP06401 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGRP06401 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGRP06401 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGRP06401 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGRP06401 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGRP06401 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGRP06401 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGRP06401 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGRP06401 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGRP06401 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGRP06401 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGRP06401 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGRP06401 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGRP06401 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGRP06401 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGRP06401 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGRP06401 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGRP06401 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGRP06401 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGRP06401 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PGRP06401 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PGRP06401 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PGRP06401 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PGRP06401 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PGRP06401 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PGRP06401 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PGRP06401 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PGRP06401 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PGRP06401 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PGRP06401 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PGRP06401 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PGRP06401 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PGRP06401 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PGRP06401 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGRP06401 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGRP06401 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGRP06401 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGRP06401 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGRP06401 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGRP06401 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGRP06401 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGRP06401 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGRP06401 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGRP06401 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGRP06401 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGRP06401 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGRP06401 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGRP06401 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGRP06401 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGRP06401 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGRP06401 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGRP06401 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGRP06401 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGRP06401 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGRP06401 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGRP06401 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGRP06401 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGRP06401 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGRP06401 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGRP06401 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGRP06401 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGRP06401 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGRP06401 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PGRP06401 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGRP06401 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGRP06401 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGRP06401 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGRP06401 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGRP06401 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PGRP06401 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGRP06401 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGRP06401 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGRP06401 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGRP06401 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGRP06401 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGRP06401 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGRP06401 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PGRP06401 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGRP06401 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGRP06401 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGRP06401 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGRP06401 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PGRP06401 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PGRP06401 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PGRP06401 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PGRP06401 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PGRP06401 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PGRP06401 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PGRP06401 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PGRP06401 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PGRP06401 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PGRP06401 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PGRP06401 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms