Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EDN1P05305 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EDN1P05305 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDN1P05305 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDN1P05305 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDN1P05305 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDN1P05305 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDN1P05305 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EDN1P05305 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDN1P05305 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDN1P05305 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDN1P05305 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDN1P05305 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDN1P05305 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDN1P05305 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDN1P05305 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EDN1P05305 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDN1P05305 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDN1P05305 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDN1P05305 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDN1P05305 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDN1P05305 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDN1P05305 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDN1P05305 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDN1P05305 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDN1P05305 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDN1P05305 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDN1P05305 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDN1P05305 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDN1P05305 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EDN1P05305 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDN1P05305 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDN1P05305 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDN1P05305 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDN1P05305 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDN1P05305 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EDN1P05305 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDN1P05305 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EDN1P05305 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EDN1P05305 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDN1P05305 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDN1P05305 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDN1P05305 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDN1P05305 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDN1P05305 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDN1P05305 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDN1P05305 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDN1P05305 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDN1P05305 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDN1P05305 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDN1P05305 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDN1P05305 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDN1P05305 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDN1P05305 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EDN1P05305 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDN1P05305 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDN1P05305 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDN1P05305 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDN1P05305 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDN1P05305 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDN1P05305 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDN1P05305 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDN1P05305 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDN1P05305 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDN1P05305 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDN1P05305 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDN1P05305 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDN1P05305 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDN1P05305 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDN1P05305 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EDN1P05305 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EDN1P05305 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDN1P05305 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDN1P05305 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDN1P05305 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDN1P05305 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDN1P05305 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDN1P05305 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDN1P05305 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDN1P05305 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDN1P05305 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDN1P05305 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EDN1P05305 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDN1P05305 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDN1P05305 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDN1P05305 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDN1P05305 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDN1P05305 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EDN1P05305 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDN1P05305 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDN1P05305 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDN1P05305 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDN1P05305 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDN1P05305 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDN1P05305 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDN1P05305 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDN1P05305 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDN1P05305 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDN1P05305 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDN1P05305 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms