Protein–RNA interactions for Protein: P02771

AFP, Alpha-fetoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFPP02771 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFPP02771 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFPP02771 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFPP02771 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFPP02771 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFPP02771 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFPP02771 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFPP02771 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFPP02771 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFPP02771 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFPP02771 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFPP02771 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFPP02771 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFPP02771 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFPP02771 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFPP02771 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFPP02771 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFPP02771 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFPP02771 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFPP02771 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFPP02771 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFPP02771 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFPP02771 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFPP02771 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFPP02771 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFPP02771 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFPP02771 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFPP02771 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
AFPP02771 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
AFPP02771 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFPP02771 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
AFPP02771 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFPP02771 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFPP02771 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFPP02771 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFPP02771 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFPP02771 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFPP02771 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFPP02771 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFPP02771 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
AFPP02771 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFPP02771 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
AFPP02771 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
AFPP02771 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFPP02771 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFPP02771 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFPP02771 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFPP02771 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFPP02771 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFPP02771 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFPP02771 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AFPP02771 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AFPP02771 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AFPP02771 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AFPP02771 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AFPP02771 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
AFPP02771 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AFPP02771 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AFPP02771 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
AFPP02771 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AFPP02771 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AFPP02771 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AFPP02771 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFPP02771 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFPP02771 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFPP02771 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFPP02771 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFPP02771 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFPP02771 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFPP02771 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AFPP02771 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AFPP02771 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AFPP02771 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AFPP02771 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AFPP02771 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AFPP02771 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AFPP02771 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
AFPP02771 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
AFPP02771 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
AFPP02771 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
AFPP02771 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AFPP02771 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AFPP02771 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AFPP02771 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AFPP02771 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AFPP02771 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AFPP02771 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AFPP02771 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AFPP02771 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AFPP02771 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AFPP02771 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AFPP02771 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AFPP02771 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AFPP02771 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AFPP02771 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AFPP02771 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AFPP02771 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AFPP02771 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
AFPP02771 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AFPP02771 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms