Protein–RNA interactions for Protein: P01033

TIMP1, Metalloproteinase inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP1P01033 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIMP1P01033 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIMP1P01033 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIMP1P01033 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIMP1P01033 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIMP1P01033 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIMP1P01033 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIMP1P01033 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIMP1P01033 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIMP1P01033 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIMP1P01033 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIMP1P01033 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIMP1P01033 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIMP1P01033 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIMP1P01033 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIMP1P01033 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIMP1P01033 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIMP1P01033 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIMP1P01033 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIMP1P01033 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIMP1P01033 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TIMP1P01033 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIMP1P01033 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIMP1P01033 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIMP1P01033 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIMP1P01033 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIMP1P01033 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIMP1P01033 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIMP1P01033 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TIMP1P01033 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TIMP1P01033 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIMP1P01033 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms