Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TSPAN13O95857 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPAN13O95857 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 269 ms