Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POP4O95707 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POP4O95707 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POP4O95707 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POP4O95707 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POP4O95707 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POP4O95707 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POP4O95707 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POP4O95707 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POP4O95707 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POP4O95707 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP4O95707 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP4O95707 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP4O95707 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP4O95707 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP4O95707 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP4O95707 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP4O95707 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POP4O95707 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP4O95707 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP4O95707 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP4O95707 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP4O95707 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POP4O95707 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
POP4O95707 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POP4O95707 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POP4O95707 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POP4O95707 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POP4O95707 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POP4O95707 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POP4O95707 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POP4O95707 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POP4O95707 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POP4O95707 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POP4O95707 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POP4O95707 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POP4O95707 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POP4O95707 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POP4O95707 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POP4O95707 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POP4O95707 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POP4O95707 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POP4O95707 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POP4O95707 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
POP4O95707 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POP4O95707 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POP4O95707 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
POP4O95707 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POP4O95707 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POP4O95707 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POP4O95707 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POP4O95707 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POP4O95707 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POP4O95707 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POP4O95707 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POP4O95707 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POP4O95707 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POP4O95707 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POP4O95707 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POP4O95707 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POP4O95707 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POP4O95707 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POP4O95707 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POP4O95707 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POP4O95707 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POP4O95707 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POP4O95707 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POP4O95707 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POP4O95707 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POP4O95707 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POP4O95707 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POP4O95707 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POP4O95707 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POP4O95707 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POP4O95707 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POP4O95707 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POP4O95707 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POP4O95707 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POP4O95707 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POP4O95707 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POP4O95707 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POP4O95707 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POP4O95707 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POP4O95707 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POP4O95707 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POP4O95707 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
POP4O95707 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POP4O95707 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POP4O95707 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POP4O95707 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POP4O95707 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POP4O95707 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POP4O95707 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POP4O95707 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POP4O95707 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POP4O95707 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POP4O95707 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POP4O95707 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POP4O95707 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POP4O95707 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms