Protein–RNA interactions for Protein: O95521

PRAMEF1, PRAME family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF1O95521 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRAMEF1O95521 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF1O95521 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms