Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOBTB3O94955 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms