Protein–RNA interactions for Protein: O94876

TMCC1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC1O94876 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCC1O94876 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCC1O94876 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCC1O94876 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms