Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCATO75600 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCATO75600 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCATO75600 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCATO75600 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCATO75600 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCATO75600 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCATO75600 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GCATO75600 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCATO75600 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCATO75600 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCATO75600 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCATO75600 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCATO75600 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCATO75600 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCATO75600 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCATO75600 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCATO75600 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCATO75600 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCATO75600 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCATO75600 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCATO75600 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCATO75600 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCATO75600 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCATO75600 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCATO75600 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GCATO75600 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCATO75600 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCATO75600 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCATO75600 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCATO75600 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GCATO75600 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCATO75600 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCATO75600 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCATO75600 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCATO75600 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCATO75600 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCATO75600 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCATO75600 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCATO75600 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCATO75600 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCATO75600 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCATO75600 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCATO75600 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCATO75600 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCATO75600 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCATO75600 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCATO75600 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCATO75600 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCATO75600 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GCATO75600 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GCATO75600 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GCATO75600 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCATO75600 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCATO75600 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCATO75600 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCATO75600 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCATO75600 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCATO75600 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCATO75600 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCATO75600 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCATO75600 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCATO75600 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCATO75600 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCATO75600 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCATO75600 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCATO75600 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCATO75600 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GCATO75600 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCATO75600 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCATO75600 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCATO75600 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GCATO75600 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCATO75600 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCATO75600 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCATO75600 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCATO75600 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCATO75600 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCATO75600 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GCATO75600 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCATO75600 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GCATO75600 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCATO75600 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCATO75600 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCATO75600 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GCATO75600 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCATO75600 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCATO75600 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCATO75600 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCATO75600 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCATO75600 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCATO75600 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCATO75600 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCATO75600 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCATO75600 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCATO75600 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCATO75600 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCATO75600 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCATO75600 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCATO75600 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms