Protein–RNA interactions for Protein: O75487

GPC4, Glypican-4, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC4O75487 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC4O75487 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC4O75487 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC4O75487 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC4O75487 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC4O75487 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC4O75487 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC4O75487 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC4O75487 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC4O75487 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC4O75487 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC4O75487 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC4O75487 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC4O75487 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC4O75487 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC4O75487 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC4O75487 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC4O75487 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC4O75487 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC4O75487 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC4O75487 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC4O75487 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC4O75487 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC4O75487 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC4O75487 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC4O75487 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC4O75487 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC4O75487 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC4O75487 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC4O75487 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC4O75487 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC4O75487 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC4O75487 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC4O75487 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC4O75487 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC4O75487 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC4O75487 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC4O75487 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC4O75487 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC4O75487 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC4O75487 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC4O75487 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC4O75487 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC4O75487 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC4O75487 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC4O75487 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC4O75487 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC4O75487 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC4O75487 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC4O75487 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC4O75487 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC4O75487 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC4O75487 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC4O75487 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC4O75487 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC4O75487 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC4O75487 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC4O75487 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC4O75487 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC4O75487 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC4O75487 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC4O75487 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC4O75487 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC4O75487 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GPC4O75487 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GPC4O75487 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC4O75487 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC4O75487 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC4O75487 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC4O75487 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC4O75487 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC4O75487 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC4O75487 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC4O75487 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC4O75487 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC4O75487 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC4O75487 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC4O75487 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC4O75487 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC4O75487 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC4O75487 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC4O75487 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC4O75487 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC4O75487 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC4O75487 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC4O75487 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC4O75487 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC4O75487 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC4O75487 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC4O75487 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC4O75487 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC4O75487 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC4O75487 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC4O75487 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC4O75487 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC4O75487 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC4O75487 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC4O75487 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC4O75487 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC4O75487 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms