Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX3O75364 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX3O75364 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX3O75364 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX3O75364 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX3O75364 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX3O75364 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX3O75364 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX3O75364 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX3O75364 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX3O75364 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX3O75364 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX3O75364 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX3O75364 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX3O75364 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX3O75364 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX3O75364 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX3O75364 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX3O75364 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX3O75364 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX3O75364 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX3O75364 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX3O75364 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX3O75364 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PITX3O75364 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PITX3O75364 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PITX3O75364 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PITX3O75364 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PITX3O75364 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PITX3O75364 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PITX3O75364 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PITX3O75364 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITX3O75364 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITX3O75364 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITX3O75364 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PITX3O75364 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITX3O75364 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PITX3O75364 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITX3O75364 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PITX3O75364 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX3O75364 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX3O75364 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX3O75364 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX3O75364 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX3O75364 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX3O75364 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX3O75364 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX3O75364 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX3O75364 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX3O75364 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX3O75364 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX3O75364 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX3O75364 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX3O75364 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX3O75364 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX3O75364 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX3O75364 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX3O75364 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX3O75364 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX3O75364 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX3O75364 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX3O75364 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX3O75364 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX3O75364 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX3O75364 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX3O75364 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX3O75364 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX3O75364 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX3O75364 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX3O75364 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX3O75364 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX3O75364 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX3O75364 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX3O75364 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX3O75364 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX3O75364 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX3O75364 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX3O75364 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX3O75364 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX3O75364 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX3O75364 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX3O75364 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX3O75364 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX3O75364 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX3O75364 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX3O75364 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX3O75364 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX3O75364 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX3O75364 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX3O75364 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX3O75364 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX3O75364 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX3O75364 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX3O75364 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX3O75364 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX3O75364 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX3O75364 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX3O75364 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX3O75364 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX3O75364 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms