Protein–RNA interactions for Protein: O75132

ZBED4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED4O75132 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZBED4O75132 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZBED4O75132 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZBED4O75132 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZBED4O75132 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZBED4O75132 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED4O75132 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED4O75132 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED4O75132 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED4O75132 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED4O75132 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED4O75132 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED4O75132 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED4O75132 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED4O75132 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED4O75132 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED4O75132 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED4O75132 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED4O75132 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED4O75132 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED4O75132 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED4O75132 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED4O75132 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED4O75132 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED4O75132 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED4O75132 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED4O75132 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED4O75132 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED4O75132 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED4O75132 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED4O75132 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED4O75132 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED4O75132 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED4O75132 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED4O75132 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZBED4O75132 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ZBED4O75132 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ZBED4O75132 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZBED4O75132 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZBED4O75132 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZBED4O75132 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZBED4O75132 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZBED4O75132 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZBED4O75132 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZBED4O75132 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZBED4O75132 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZBED4O75132 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms