Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN2BO60939 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN2BO60939 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN2BO60939 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN2BO60939 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN2BO60939 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN2BO60939 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCN2BO60939 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCN2BO60939 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN2BO60939 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN2BO60939 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN2BO60939 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms