Protein–RNA interactions for Protein: O60930

RNASEH1, Ribonuclease H1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASEH1O60930 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RNASEH1O60930 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNASEH1O60930 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNASEH1O60930 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNASEH1O60930 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNASEH1O60930 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNASEH1O60930 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNASEH1O60930 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNASEH1O60930 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNASEH1O60930 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNASEH1O60930 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNASEH1O60930 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNASEH1O60930 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNASEH1O60930 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNASEH1O60930 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNASEH1O60930 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNASEH1O60930 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNASEH1O60930 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RNASEH1O60930 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RNASEH1O60930 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNASEH1O60930 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNASEH1O60930 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNASEH1O60930 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNASEH1O60930 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNASEH1O60930 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNASEH1O60930 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNASEH1O60930 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNASEH1O60930 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNASEH1O60930 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNASEH1O60930 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNASEH1O60930 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNASEH1O60930 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNASEH1O60930 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNASEH1O60930 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNASEH1O60930 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNASEH1O60930 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNASEH1O60930 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RNASEH1O60930 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNASEH1O60930 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RNASEH1O60930 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RNASEH1O60930 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNASEH1O60930 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNASEH1O60930 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNASEH1O60930 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNASEH1O60930 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RNASEH1O60930 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms