Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSVO60911 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSVO60911 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSVO60911 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSVO60911 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSVO60911 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSVO60911 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSVO60911 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSVO60911 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSVO60911 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSVO60911 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSVO60911 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSVO60911 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSVO60911 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSVO60911 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSVO60911 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSVO60911 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSVO60911 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTSVO60911 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSVO60911 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSVO60911 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSVO60911 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSVO60911 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSVO60911 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSVO60911 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSVO60911 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CTSVO60911 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTSVO60911 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSVO60911 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTSVO60911 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSVO60911 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSVO60911 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSVO60911 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSVO60911 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSVO60911 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CTSVO60911 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CTSVO60911 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTSVO60911 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTSVO60911 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSVO60911 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTSVO60911 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSVO60911 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSVO60911 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSVO60911 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSVO60911 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTSVO60911 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTSVO60911 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTSVO60911 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTSVO60911 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTSVO60911 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CTSVO60911 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTSVO60911 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTSVO60911 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTSVO60911 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTSVO60911 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTSVO60911 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTSVO60911 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTSVO60911 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CTSVO60911 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTSVO60911 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTSVO60911 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CTSVO60911 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTSVO60911 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTSVO60911 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTSVO60911 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTSVO60911 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTSVO60911 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTSVO60911 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTSVO60911 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CTSVO60911 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTSVO60911 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTSVO60911 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CTSVO60911 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTSVO60911 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTSVO60911 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTSVO60911 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CTSVO60911 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTSVO60911 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTSVO60911 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTSVO60911 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTSVO60911 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTSVO60911 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTSVO60911 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTSVO60911 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTSVO60911 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTSVO60911 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTSVO60911 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTSVO60911 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.28■■□□□ 1
CTSVO60911 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTSVO60911 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CTSVO60911 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTSVO60911 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTSVO60911 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTSVO60911 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTSVO60911 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTSVO60911 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTSVO60911 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTSVO60911 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTSVO60911 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTSVO60911 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms