Protein–RNA interactions for Protein: O60749

SNX2, Sorting nexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX2O60749 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX2O60749 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX2O60749 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX2O60749 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX2O60749 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX2O60749 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX2O60749 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX2O60749 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX2O60749 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX2O60749 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX2O60749 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX2O60749 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX2O60749 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX2O60749 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX2O60749 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX2O60749 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SNX2O60749 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SNX2O60749 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX2O60749 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX2O60749 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX2O60749 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX2O60749 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX2O60749 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX2O60749 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX2O60749 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX2O60749 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX2O60749 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX2O60749 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX2O60749 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX2O60749 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX2O60749 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX2O60749 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX2O60749 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX2O60749 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX2O60749 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX2O60749 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX2O60749 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX2O60749 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX2O60749 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX2O60749 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX2O60749 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX2O60749 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX2O60749 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX2O60749 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX2O60749 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX2O60749 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX2O60749 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX2O60749 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX2O60749 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX2O60749 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX2O60749 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX2O60749 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX2O60749 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX2O60749 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX2O60749 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX2O60749 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX2O60749 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX2O60749 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX2O60749 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX2O60749 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX2O60749 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX2O60749 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX2O60749 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX2O60749 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX2O60749 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX2O60749 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX2O60749 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX2O60749 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX2O60749 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX2O60749 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX2O60749 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX2O60749 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX2O60749 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX2O60749 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX2O60749 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX2O60749 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX2O60749 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX2O60749 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX2O60749 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX2O60749 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX2O60749 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX2O60749 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX2O60749 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SNX2O60749 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX2O60749 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX2O60749 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX2O60749 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX2O60749 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX2O60749 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX2O60749 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX2O60749 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX2O60749 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX2O60749 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX2O60749 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX2O60749 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX2O60749 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX2O60749 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX2O60749 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX2O60749 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX2O60749 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms