Protein–RNA interactions for Protein: O60609

GFRA3, GDNF family receptor alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA3O60609 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GFRA3O60609 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GFRA3O60609 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms