Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PPLO60437 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PPLO60437 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PPLO60437 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PPLO60437 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PPLO60437 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PPLO60437 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PPLO60437 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
PPLO60437 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PPLO60437 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PPLO60437 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PPLO60437 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PPLO60437 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PPLO60437 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PPLO60437 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PPLO60437 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PPLO60437 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PPLO60437 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PPLO60437 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PPLO60437 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PPLO60437 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PPLO60437 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PPLO60437 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PPLO60437 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PPLO60437 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PPLO60437 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PPLO60437 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PPLO60437 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PPLO60437 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PPLO60437 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PPLO60437 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PPLO60437 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PPLO60437 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PPLO60437 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PPLO60437 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PPLO60437 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PPLO60437 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
PPLO60437 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PPLO60437 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PPLO60437 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PPLO60437 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PPLO60437 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
PPLO60437 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
PPLO60437 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PPLO60437 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PPLO60437 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
PPLO60437 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PPLO60437 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
PPLO60437 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PPLO60437 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PPLO60437 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
PPLO60437 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PPLO60437 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PPLO60437 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PPLO60437 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PPLO60437 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PPLO60437 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PPLO60437 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PPLO60437 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
PPLO60437 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PPLO60437 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PPLO60437 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PPLO60437 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PPLO60437 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PPLO60437 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PPLO60437 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PPLO60437 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PPLO60437 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PPLO60437 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PPLO60437 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PPLO60437 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PPLO60437 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PPLO60437 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PPLO60437 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PPLO60437 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PPLO60437 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PPLO60437 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PPLO60437 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PPLO60437 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PPLO60437 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PPLO60437 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PPLO60437 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PPLO60437 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PPLO60437 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PPLO60437 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PPLO60437 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PPLO60437 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PPLO60437 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
PPLO60437 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PPLO60437 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PPLO60437 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PPLO60437 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PPLO60437 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PPLO60437 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PPLO60437 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
PPLO60437 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
PPLO60437 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PPLO60437 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
PPLO60437 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PPLO60437 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms