Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP8B3O60423 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP8B3O60423 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms