Protein–RNA interactions for Protein: O60304

ZNF500, Zinc finger protein 500, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF500O60304 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF500O60304 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF500O60304 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF500O60304 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF500O60304 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF500O60304 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF500O60304 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF500O60304 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF500O60304 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF500O60304 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF500O60304 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms