Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAK2O60296 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms