Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VEGFDO43915 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VEGFDO43915 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VEGFDO43915 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VEGFDO43915 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VEGFDO43915 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VEGFDO43915 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VEGFDO43915 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VEGFDO43915 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VEGFDO43915 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VEGFDO43915 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VEGFDO43915 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VEGFDO43915 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VEGFDO43915 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VEGFDO43915 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VEGFDO43915 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
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VEGFDO43915 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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VEGFDO43915 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VEGFDO43915 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VEGFDO43915 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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