Protein–RNA interactions for Protein: O43809

NUDT21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT21O43809 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUDT21O43809 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NUDT21O43809 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUDT21O43809 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUDT21O43809 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUDT21O43809 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUDT21O43809 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUDT21O43809 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUDT21O43809 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUDT21O43809 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUDT21O43809 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUDT21O43809 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUDT21O43809 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUDT21O43809 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUDT21O43809 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NUDT21O43809 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUDT21O43809 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUDT21O43809 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUDT21O43809 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUDT21O43809 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUDT21O43809 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUDT21O43809 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUDT21O43809 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUDT21O43809 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUDT21O43809 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUDT21O43809 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUDT21O43809 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUDT21O43809 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUDT21O43809 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUDT21O43809 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUDT21O43809 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUDT21O43809 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUDT21O43809 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUDT21O43809 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUDT21O43809 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUDT21O43809 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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