Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
STX6O43752 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
STX6O43752 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
STX6O43752 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
STX6O43752 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
STX6O43752 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
STX6O43752 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
STX6O43752 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
STX6O43752 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
STX6O43752 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
STX6O43752 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
STX6O43752 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
STX6O43752 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
STX6O43752 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
STX6O43752 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
STX6O43752 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
STX6O43752 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
STX6O43752 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
STX6O43752 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
STX6O43752 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
STX6O43752 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
STX6O43752 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
STX6O43752 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
STX6O43752 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
STX6O43752 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
STX6O43752 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
STX6O43752 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
STX6O43752 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
STX6O43752 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
STX6O43752 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
STX6O43752 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
STX6O43752 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
STX6O43752 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
STX6O43752 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
STX6O43752 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
STX6O43752 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
STX6O43752 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
STX6O43752 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
STX6O43752 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
STX6O43752 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
STX6O43752 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
STX6O43752 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
STX6O43752 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
STX6O43752 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
STX6O43752 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
STX6O43752 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
STX6O43752 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
STX6O43752 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
STX6O43752 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
STX6O43752 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
STX6O43752 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
STX6O43752 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
STX6O43752 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
STX6O43752 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STX6O43752 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STX6O43752 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STX6O43752 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
STX6O43752 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STX6O43752 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STX6O43752 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STX6O43752 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STX6O43752 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STX6O43752 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STX6O43752 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STX6O43752 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STX6O43752 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STX6O43752 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
STX6O43752 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
STX6O43752 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
STX6O43752 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
STX6O43752 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
STX6O43752 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
STX6O43752 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
STX6O43752 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
STX6O43752 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
STX6O43752 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
STX6O43752 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
STX6O43752 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STX6O43752 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STX6O43752 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STX6O43752 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STX6O43752 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STX6O43752 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STX6O43752 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STX6O43752 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STX6O43752 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
STX6O43752 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
STX6O43752 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STX6O43752 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STX6O43752 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
STX6O43752 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
STX6O43752 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
STX6O43752 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
STX6O43752 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
STX6O43752 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
STX6O43752 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
STX6O43752 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
STX6O43752 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
STX6O43752 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
STX6O43752 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms