Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTRA2O43464 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms