Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATMINO43313 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATMINO43313 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATMINO43313 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATMINO43313 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ATMINO43313 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ATMINO43313 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATMINO43313 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATMINO43313 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ATMINO43313 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATMINO43313 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATMINO43313 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATMINO43313 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATMINO43313 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATMINO43313 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATMINO43313 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATMINO43313 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATMINO43313 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATMINO43313 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATMINO43313 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATMINO43313 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATMINO43313 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATMINO43313 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATMINO43313 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATMINO43313 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATMINO43313 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATMINO43313 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATMINO43313 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATMINO43313 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATMINO43313 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATMINO43313 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATMINO43313 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATMINO43313 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATMINO43313 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATMINO43313 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATMINO43313 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATMINO43313 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATMINO43313 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATMINO43313 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATMINO43313 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATMINO43313 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATMINO43313 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATMINO43313 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATMINO43313 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATMINO43313 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATMINO43313 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATMINO43313 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATMINO43313 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATMINO43313 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATMINO43313 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATMINO43313 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATMINO43313 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATMINO43313 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATMINO43313 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATMINO43313 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATMINO43313 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATMINO43313 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATMINO43313 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATMINO43313 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATMINO43313 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATMINO43313 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATMINO43313 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATMINO43313 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATMINO43313 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATMINO43313 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATMINO43313 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATMINO43313 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATMINO43313 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATMINO43313 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATMINO43313 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATMINO43313 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATMINO43313 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATMINO43313 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATMINO43313 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATMINO43313 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATMINO43313 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATMINO43313 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATMINO43313 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATMINO43313 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATMINO43313 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATMINO43313 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATMINO43313 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATMINO43313 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATMINO43313 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATMINO43313 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATMINO43313 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATMINO43313 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATMINO43313 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATMINO43313 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATMINO43313 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATMINO43313 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATMINO43313 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATMINO43313 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATMINO43313 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATMINO43313 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATMINO43313 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATMINO43313 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATMINO43313 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATMINO43313 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATMINO43313 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms